Duben 2016: Single Cell Gene Expression Analysis – praktický kurz EMBO

Pavel Burda byl jedním z šestnácti mladých vědců z celého světa, kteří byli vybráni organizátory kurzu EMBO na základě hodnocení zaslaných aplikací. Díky své úspěšné přihlášce a žádosti měl možnost absolvovat tento velice intenzivní týdenní praktický kurz v laboratořích  EMBL (The European Molecular Biology Laboratory) v německém Heidelbergu.

Kurz se věnoval progresivním moderním metodám pro analýzu molekulárních dějů na úrovni jednotlivých buněk, tzv. single cell analýze. Náplní byla teoretická i praktická část spojená s představením metod pro izolaci individuálních buněk (FACS, LCM) a následnou expresní analýzou (qRTPCR, Next Generation Sequencing, Fluidigm system). Vše probíhalo v režii vedoucích úspěšných evropských „single cell" laboratoří, kdy se mnozí z nich přímo na vývoji metod významně podíleli (M. Kubista, M. Pfaffl, A. Ståhlberg a další).

Pavel byl z kurzu nadšený, přičemž vyzdvihl individuální přístup a možnost diskuse s experty o perspektivě a limitacích jednotlivých metod pro konkrétní výzkumné projekty každého zúčastněného. Akce nabídla velmi komplexní přehled o nových trendech buněčné analýzy, které se v blízké budoucnosti nepochybně stanou rutinou každé moderní molekulárně-genetické laboratoře. Pavel přivezl na pracoviště ÚHKT know-how v oblasti single cell analýzy, které nejprve uplatníme na in vitro modelech v rámci řešení výzkumných projektů našeho oddělení.

Kurz v obrázcích naleznete ve Fotogalerii ZDE.